Sindikat zavoda SŠOF je samostojna, demokratična in nestrankarska interesna organizacija, v katero se lahko vključujejo vsi zaposleni v zavodu.
Sindikat deluje samostojno in neodvisno na podlagi pravil (statuta) sindikata zavoda in programskih usmeritev SVIZ.

Organi Sindikata SŠOF so:
•    zbor sindikata zavoda (vsi člani Sindikata SŠOF)
•    sindikalni zaupnik in predsednik Izvršilnega odbora SŠOF
•    namestnik sindikalnega zaupnika
•    Izvršilni odbor Sindikata SŠOF


Mandat članov organov sindikata zavoda traja štiri leta. Začetek in konec mandata določi izvršilni odbor v sklepu o razpisu volitev. Izvršilni odbor sindikata imenuje člane kandidacijsko-volilne komisije, ki pa ne smejo biti člani katerega koli organa sindikata zavoda.